刑事拘留的刑事档案不能消除。
刑事档案一般指某人过去犯法或犯罪行为的记录。又称犯罪人员犯罪记录制度，在我国法律中一般指有过刑事犯罪前科的档案记录，而该犯罪档案一般存放至公安部门保存。
《公安机关出具有无违法犯罪记录证明工作规定》规定，本规定所称的违法犯罪记录证明事项不包括以下情形：
因没有犯罪事实(含证据不足，不能认定有罪)，或者有《刑事诉讼法》第十五条规定情形之一，检察机关作出的不起诉决定和法院作出的无罪判决;拘传、取保候审、监视居住、刑事拘留、逮捕等刑事强制措施信息。
《公安机关办理刑事案件程序规定》规定，经过侦查，发现具有下列情形之一的，应当撤销案件：
(一)没有犯罪事实的;
(二)情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的;
(三)犯罪已过追诉时效期限的;
(四)经特赦令免除刑罚的;
(五)犯罪嫌疑人死亡的;
(六)其他依法不追究刑事责任的。
法律依据：
《公安机关出具有无违法犯罪记录证明工作规定》第一百八十三条
经过侦查，发现具有下列情形之一的，应当撤销案件：
（一） 没有犯罪事实的；
（二） 情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；
（三） 犯罪已过追诉时效期限的；
（四） 经特赦令免除刑罚的；
（五） 犯罪嫌疑人死亡的；
（六） 其他依法不追究刑事责任的。
对于经过侦查，发现有犯罪事实需要追究刑事责任，但不是被立案侦查的犯罪嫌疑人实施的，或者共同犯罪案件中部分犯罪嫌疑人不够刑事处罚的，应当对有关犯罪嫌疑人终止侦查，并对该案件继续侦查。