醉酒驾驶电动自行车一般会按照酒后驾驶非机动车进行处罚。根据相关规定通常会处警告或者五元以上五十元以下罚款；非机动车驾驶人拒绝接受罚款处罚的可以扣留其非机动车。比如《道路交通安全法》第八十九条规定行人、乘车人、非机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的处警告或者五元以上五十元以下罚款；非机动车驾驶人拒绝接受罚款处罚的可以扣留其非机动车。具体罚款数额会因地区不同而有差异有的地方可能会按照上限罚款五十元有的地方可能会根据实际情况在五元到五十元之间酌定。
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