1. 若在单位犯罪中只起诉个人法院应审查案件事实。如果认为有证据证明犯罪行为是单位实施且符合单位犯罪特征应建议检察院补充起诉单位。依据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国刑事诉讼法〉的解释》第二百八十条规定对应当认定为单位犯罪的案件人民检察院只作为自然人犯罪起诉的人民法院应当建议人民检察院对犯罪单位补充起诉。2. 若检察院坚持只起诉个人法院仍应按照审理自然人犯罪的程序对个人进行审判。在判决时需综合考量个人在单位犯罪中的作用、地位等情节依法定罪量刑。3. 之后若发现确有遗漏单位犯罪主体检察院可依审判监督程序提出抗诉法院也可通过再审程序纠正以确保对单位犯罪的全面、准确认定和处理。
以上是律师的法律建议,如有疑问,欢迎进一步咨询。