部队申请离婚的程序如下:1. 申请:双方需向所在单位团级以上政治机关提出离婚申请。2. 审查:政治机关会对申请进行审查包括了解双方婚姻状况、离婚原因等。3. 调解:如符合离婚条件政治机关会进行调解促使双方慎重考虑离婚问题。4. 出具证明:经调解无效且符合离婚条件的政治机关出具同意离婚的证明。5. 办理离婚:双方携带证明及相关证件到地方婚姻登记机关办理离婚手续。需要注意的是现役军人的配偶要求离婚须得军人同意但军人一方有重大过错的除外。重大过错包括重婚或有配偶者与他人同居的;实施家庭暴力或虐待、遗弃家庭成员的;有赌博、吸毒等恶习屡教不改的等情况。在整个过程中要严格按照部队和地方的规定及程序来办理确保离婚手续合法、有效。
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