个体户注销营业执照的程序如下：
1、先将公司银行账户中的钱全部转走，进行银行销户，须携带开户的所有资料，包括营业执照正副本，税务登记证正副本，银行开户许可证，机构信用代码证，法人身份证和经办人身份证原件及复印件，公章，财务专用章，名章。
2、如果有未开具的空白发票，先在开票系统中将未开具的空白发票进行作废。
3、带着发票领购簿和未开具的空白发票到税务局进行验票，没有问题后，税务局会收回发票领购簿并告知回去对金税盘进行修改时钟，并进行抄当月税，具体的流程可以咨询当地的金税盘服务企业。
4、金税盘修改好时钟，完成抄税后，携带金税盘，税务登记证正副本，公章，对金税盘和税务登记进行注销，税务局受理后3-5个工作日会出具税务事项通知书予以核准注销。
5、携带营业执照正副本、和税务局出具税务事项通知书原件及复印件、公章到工商局注销营业执照。
6、这样个体户就基本成功注销掉营业执照了。

法律依据：
《企业登记程序规定》第十六条　
企业登记机关作出准予企业名称预先核准的，应当出具《企业名称预先核准通知书》；作出准予企业设立登记的，应当出具《准予设立登记通知书》，告知申请人自决定之日起十日内，领取营业执照；作出准予企业变更登记的，应当出具《准予变更登记通知书》，告知申请人自决定之日起十日内，换发营业执照；作出准予企业注销登记的，应当出具《准予注销登记通知书》，收缴营业执照。