合同补充协议，是指当事人对于合同中的内容没有约定或者约定不明的，而另行达成的条款。补充条款与主合同之间是主从关系，补充条款是从合同。主合同不受补充条款的制约而独立存在。补充条款的成立生效与主合同成立生效的条件相同，依法成立的补充条款，成立即生效。
一般情况下，补充条款与主合同内容有冲突的，以补充条款为准。
那么，合同补充协议要怎么写才有效呢？
补充协议的成立生效与主合同成立生效的依据相同，补充协议有效须具备形式要件和实质要件。
实质要件包括三个方面：①主体合格。即当事人应具备相应的民事行为能力。②当事人意思表示真实。③不违反法律行政法规强制性规定，不损害社会公共利益，不违背公序良俗。
形式要件包括两个方面：①法律、行政法规规定采用书面形式的，应当采用书面形式；②当事人约定采用书面形式的，应当采用书面形式。
法律依据：
《中华人民共和国合同法》第六十一条
合同生效后，当事人就质量、价款或者报酬、履行地点等内容没有约定或者约定不明确的，可以协议补充；不能达成补充协议的，按照合同有关条款或者交易习惯确定。