劳动合同所规定的两种情形下可以约定违约金：
(1)接受了用人单位的专项培训，并且签订了服务期限，劳动者违反服务期限的，需要支付违约金; 违约金的金额不得超过用人单位提供的培训费用。用人单位要求劳动者支付的违约金不得超过服务期限尚未履行的部分所应分摊部分。
用人单位与劳动者约定服务期限的，不影响按照正常的工资调整机制提高劳动者在服务期限的劳动报酬。
(2)劳动者签订了竞业限制约定，违反了协议的相关内容，需要支付违约金。
(3)劳动合同法所规定的除了以上两种情形可以约定违约金以外，其他不能设定违约金;
因此，自动离职，没有交接工作的用人单位可以追究其损失，对单位造成的损失，但是不能追究其相关的违约金。
法律依据：
《中华人民共和国劳动合同法》第二十二条规定《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条规定