变更程序如下：
(1)提出变更的要约：用人单位或劳动者提出变更劳动合同的要求，说明变更合同的理由、变更的内容以及变更的条件，请求对方在一定期限内给予答复。
(2)承诺：合同另一方接到对方的变更请求后，应当及时进行答复，明确告知对方同意或是不同意变更;
(3)订立书面变更协议：当事人双方就变更劳动合同的内容经过平等协商，取得一致意见后签订书面变更协议，协议载明变更的具体内容，经双方签字盖章后生效。变更后的劳动合同文本由用人单位和劳动者各执一份。
具体有以下几种情形：
1、 试用期内。
2、 签订劳动合同时的法律、行政法规发生变化，劳动合同的相关条款应作相应变更。
3、 劳动者患病或因工负伤，医疗期后不能从事原工作。
4、 劳动者不能胜任工作，用人单位对其工作岗位予以调整。
5、发生不可抗力或出现致使劳动合同全部或部分条款无法履行的其他情况，如企业发生分立、合并、迁移、被兼并、企业资产转移、转产转型、技术改造后某些生产岗位消失等。
法律依据：
《中华人民共和国劳动合同法》第三十五条
用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容。变更劳动合同，应当采用书面形式。
变更后的劳动合同文本由用人单位和劳动者各执一份。