在劳动争议案件中，不管是申请仲裁还是一审都是会组织调解的，那么二审程序中会调解吗?一般来讲是会组织调解的，但调解时遵循自愿原则的，根据我国民事诉讼法的相关规定，人民法院审理民事案件，根据当事人自愿的原则，在事实清楚的基础上，分清是非，进行调解。调解达成协议，必须双方自愿，不得强迫。
调解协议的内容不得违反法律规定。如果其中一方当事人不同意调解，或者同意调解但是双方意见分歧比较大，即为调解不成，法院就会开庭审理。如果调解成功，一般会制作调解笔录和调解协议，由双方当事人签字或盖章，一般签字之后就发生了法律效力，仲裁委会据此制作调解书后，会通知双方去拿或者邮寄给双方。
在调解或达成协议签字之前最好咨询下当地律师，充分了解自己的权利和义务，以防止自己的权益受到损害。
法律依据：
《中华人民共和国民事诉讼法》第九十三条
人民法院审理民事案件，根据当事人自愿的原则，在事实清楚的基础上，分清是非，进行调解。
《中华人民共和国民事诉讼法》第九十六条
调解达成协议，必须双方自愿，不得强迫。调解协议的内容不得违反法律规定。