医疗纠纷的诉讼程序有以下几个步骤：
1、确定管辖法院
患方如提起医疗侵权之诉或医疗技术服务合同之诉，由医疗机构所在地法院管辖。医方如提起医疗技术服务合同之诉，可选择患方所在地或医方所在地法院管辖。
2、证据保全
为防止医疗机构伪造、隐匿、篡改、销毁病史或者防止尸体、检验标本等灭失或为了查阅和复制涉案证据，患方应当在向法院起诉前固定证据或者在举证期限提出证据保全或调取申请。
3、证据交换与质证
⑴审查病历资料是否完整;⑵审查病历资料书写是否符合《病史书写基本规范》的规定;⑶决定是否申请司法文痕鉴定;⑷确定是否存在鉴定不能的情形。
4、鉴定程序
一般在涉及医疗纠纷的案件都需要进行医疗过错、因果关系、原因力大小等鉴定，必要时进行伤残等级、后续治疗费等鉴定。
5、鉴定后质证
在鉴定意见出来后，人民法院会组织双方对鉴定意见进行质证，在该环节医患双方可以申请重新鉴定、鉴定人出庭作证、专家辅助人出庭作证，以帮助对鉴定意见的质证。
6、判决，最后环节就是人民法院进行判决。
法律依据：
《医疗事故处理条例》第四十六条
发生医疗事故的赔偿等民事责任争议，医患双方可以协商解决;不愿意协商或者协商不成的，当事人可以向卫生行政部门提出调解申请，也可以直接向人民法院提起民事诉讼。
《医疗事故处理条例》第四十七条双方当事人协商解决医疗事故的赔偿等民事责任争议的，应当制作协议书。协议书应当载明双方当事人的基本情况和医疗事故的原因、双方当事人共同认定的医疗事故等级以及协商确定的赔偿数额等，并由双方当事人在协议书上签名。