工伤保险是国家对因工受伤职工获得医疗救治和经济补偿的基本保障，具有补偿性，其目的在于维护劳动者的生存权，保障劳动者的基本生活。职工因工致残被鉴定为相应伤残等级的，应当享受相应的工伤保险待遇。虽然法律规定劳动者与用人单位因工伤待遇发生纠纷时，纠纷双方可通过协商方式自行解决争议，但是如果协议约定的给付数额明显低于法定标准，违背公平原则，仍属无效。
虽然双方协商后达成赔偿协议，但若侵害了劳动者的合法权益，法院将会认定该协议无效。
法律依据：
《中华人民共和国合同法》　
第五十二条　有下列情形之一的，合同无效：(一)一方以欺诈、胁迫的手段订立合同，损害国家利益;(二)恶意串通，损害国家、集体或者第三人利益;(三)以合法形式掩盖非法目的;(四)损害社会公共利益;(五)违反法律、行政法规的强制性规定。
第五十三条　合同中的下列免责条款无效：(一)造成对方人身伤害的;(二)因故意或者重大过失造成对方财产损失的。
第五十四条　下列合同，当事人一方有权请求人民法院或者仲裁机构变更或者撤销：(一)因重大误解订立的;(二)在订立合同时显失公平的。一方以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使对方在违背真实意思的情况下订立的合同，受损害方有权请求人民法院或者仲裁机构变更或者撤销。当事人请求变更的，人民法院或者仲裁机构不得撤销。