协商解除劳动合同后，员工以生病或怀孕反悔，公司如何处理

公司可以拒绝员工的反悔行为，也可以申请劳动仲裁确认劳动合同已经解除。
协议解除劳动合同时，不存在欺诈或胁迫，也不存在显失公平或重大误解的情况，且协议内容合法，是双方真实意思的表示，双方均受协议约束。
有关法律虽然规定了女职工在孕期、产期、哺乳期内，用人单位不得解除劳动合同，但仅适用于用人单位单方解除劳动合同且员工无过错的情况，不适用协商解除劳动合同。
因此，用人单位可以拒绝员工的反悔行为，也可以向劳动仲裁委员会申请劳动仲裁。
协商解除劳动合同，应当及时签订书面的解除协议。

风险提示：协商解除劳动合同后，员工以各种理由返悔都不影响合同解除的事实，但如果协商存在经济补偿金，而经济补偿金与法定金额相差较大的情况下，员工是可以主张解除协议有重大误解或显失公平的。因此企业在与员工签订解除协议时应当保证合法公平的原则。